Para evitar los problemas de falsificación, autenticidad y confidencialidad que se pueden generar con el uso de las comunicaciones por Internet, RedIRIS ha fomentado el uso de programas como PGP y GnuPG que permiten el cifrado y la firma de la información cuando se transmite por la red. Para ello RedIRIS mantiene un servidor de claves públicas PGP en http://www.rediris.es/keyserver y realiza diversas actividades de formación y concienciación con las instituciones afiliadas.